Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actg1P63260 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg1P63260 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg1P63260 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Actg1P63260 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Actg1P63260 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Actg1P63260 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actg1P63260 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Actg1P63260 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Actg1P63260 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actg1P63260 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms