Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Barhl1P63157 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Barhl1P63157 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Barhl1P63157 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Barhl1P63157 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Barhl1P63157 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Barhl1P63157 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Barhl1P63157 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Barhl1P63157 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Barhl1P63157 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Barhl1P63157 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Barhl1P63157 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Barhl1P63157 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Barhl1P63157 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Barhl1P63157 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Barhl1P63157 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Barhl1P63157 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Barhl1P63157 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Barhl1P63157 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Barhl1P63157 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Barhl1P63157 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Barhl1P63157 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Barhl1P63157 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Barhl1P63157 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Barhl1P63157 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Barhl1P63157 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Barhl1P63157 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Barhl1P63157 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Barhl1P63157 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Barhl1P63157 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms