Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2bP62915 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf2bP62915 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf2bP62915 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms