Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3cP62823 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3cP62823 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms