Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra1P62812 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabra1P62812 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms