Protein–RNA interactions for Protein: P62305

Snrpe, Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpeP62305 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SnrpeP62305 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpeP62305 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms