Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps29P62274 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps29P62274 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rps29P62274 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rps29P62274 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rps29P62274 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rps29P62274 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rps29P62274 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rps29P62274 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rps29P62274 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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