Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ufm1P61961 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ufm1P61961 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ufm1P61961 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ufm1P61961 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ufm1P61961 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ufm1P61961 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ufm1P61961 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ufm1P61961 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ufm1P61961 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ufm1P61961 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ufm1P61961 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ufm1P61961 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ufm1P61961 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ufm1P61961 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ufm1P61961 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ufm1P61961 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ufm1P61961 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ufm1P61961 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms