Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copz1P61924 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Copz1P61924 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Copz1P61924 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Copz1P61924 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Copz1P61924 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Copz1P61924 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Copz1P61924 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Copz1P61924 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Copz1P61924 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Copz1P61924 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Copz1P61924 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Copz1P61924 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Copz1P61924 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Copz1P61924 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Copz1P61924 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Copz1P61924 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Copz1P61924 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Copz1P61924 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Copz1P61924 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Copz1P61924 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Copz1P61924 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Copz1P61924 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms