Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vbp1P61759 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vbp1P61759 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms