Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ube2kP61087 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Ube2kP61087 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2kP61087 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.2 ms