Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ActbP60710 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ActbP60710 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ActbP60710 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ActbP60710 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ActbP60710 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ActbP60710 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ActbP60710 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ActbP60710 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ActbP60710 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ActbP60710 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ActbP60710 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ActbP60710 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ActbP60710 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ActbP60710 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ActbP60710 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ActbP60710 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ActbP60710 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ActbP60710 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ActbP60710 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ActbP60710 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ActbP60710 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ActbP60710 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ActbP60710 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ActbP60710 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ActbP60710 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ActbP60710 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ActbP60710 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ActbP60710 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ActbP60710 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ActbP60710 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ActbP60710 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ActbP60710 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ActbP60710 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ActbP60710 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ActbP60710 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ActbP60710 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ActbP60710 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ActbP60710 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ActbP60710 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ActbP60710 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ActbP60710 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ActbP60710 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ActbP60710 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ActbP60710 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ActbP60710 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ActbP60710 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ActbP60710 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ActbP60710 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ActbP60710 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ActbP60710 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ActbP60710 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ActbP60710 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ActbP60710 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ActbP60710 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ActbP60710 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ActbP60710 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ActbP60710 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ActbP60710 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ActbP60710 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ActbP60710 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ActbP60710 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ActbP60710 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ActbP60710 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ActbP60710 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ActbP60710 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ActbP60710 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ActbP60710 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ActbP60710 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ActbP60710 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ActbP60710 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ActbP60710 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ActbP60710 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ActbP60710 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ActbP60710 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ActbP60710 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ActbP60710 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ActbP60710 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ActbP60710 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ActbP60710 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ActbP60710 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ActbP60710 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ActbP60710 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ActbP60710 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ActbP60710 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ActbP60710 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ActbP60710 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ActbP60710 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ActbP60710 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ActbP60710 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ActbP60710 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ActbP60710 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ActbP60710 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ActbP60710 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ActbP60710 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ActbP60710 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ActbP60710 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ActbP60710 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ActbP60710 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ActbP60710 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms