Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P58686 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
P58686 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
P58686 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P58686 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
P58686 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P58686 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P58686 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
P58686 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P58686 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P58686 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P58686 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P58686 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P58686 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P58686 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P58686 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P58686 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
P58686 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P58686 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P58686 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P58686 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P58686 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P58686 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P58686 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P58686 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P58686 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P58686 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P58686 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P58686 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P58686 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P58686 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P58686 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P58686 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P58686 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P58686 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P58686 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P58686 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P58686 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P58686 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P58686 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P58686 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P58686 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P58686 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P58686 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P58686 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P58686 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P58686 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P58686 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P58686 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P58686 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P58686 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
P58686 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P58686 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P58686 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P58686 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P58686 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P58686 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P58686 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P58686 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P58686 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P58686 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P58686 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P58686 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P58686 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P58686 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P58686 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P58686 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P58686 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P58686 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P58686 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P58686 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P58686 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P58686 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P58686 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P58686 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P58686 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P58686 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P58686 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P58686 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P58686 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P58686 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P58686 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P58686 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P58686 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P58686 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P58686 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P58686 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P58686 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P58686 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P58686 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P58686 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P58686 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P58686 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P58686 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P58686 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P58686 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P58686 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P58686 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P58686 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P58686 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms