Protein–RNA interactions for Protein: P58682

Tlr8, Toll-like receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr8P58682 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tlr8P58682 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tlr8P58682 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tlr8P58682 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tlr8P58682 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tlr8P58682 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tlr8P58682 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tlr8P58682 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tlr8P58682 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms