Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Paxbp1P58501 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Paxbp1P58501 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Paxbp1P58501 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms