Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdsp1P58466 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp1P58466 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms