Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Smpdl3bP58242 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smpdl3bP58242 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Smpdl3bP58242 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smpdl3bP58242 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smpdl3bP58242 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smpdl3bP58242 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smpdl3bP58242 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smpdl3bP58242 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smpdl3bP58242 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smpdl3bP58242 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smpdl3bP58242 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smpdl3bP58242 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smpdl3bP58242 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smpdl3bP58242 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smpdl3bP58242 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smpdl3bP58242 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smpdl3bP58242 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smpdl3bP58242 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smpdl3bP58242 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smpdl3bP58242 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smpdl3bP58242 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smpdl3bP58242 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smpdl3bP58242 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smpdl3bP58242 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smpdl3bP58242 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Smpdl3bP58242 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smpdl3bP58242 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smpdl3bP58242 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smpdl3bP58242 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms