Protein–RNA interactions for Protein: P57748

Mmp20, Matrix metalloproteinase-20, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp20P57748 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mmp20P57748 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mmp20P57748 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mmp20P57748 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mmp20P57748 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mmp20P57748 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mmp20P57748 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mmp20P57748 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mmp20P57748 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mmp20P57748 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mmp20P57748 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mmp20P57748 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mmp20P57748 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mmp20P57748 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mmp20P57748 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mmp20P57748 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mmp20P57748 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp20P57748 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp20P57748 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp20P57748 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp20P57748 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp20P57748 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp20P57748 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mmp20P57748 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mmp20P57748 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms