Protein–RNA interactions for Protein: P56959

Fus, RNA-binding protein FUS, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FusP56959 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FusP56959 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FusP56959 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FusP56959 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FusP56959 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FusP56959 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FusP56959 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FusP56959 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FusP56959 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FusP56959 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FusP56959 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FusP56959 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FusP56959 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FusP56959 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FusP56959 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FusP56959 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FusP56959 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FusP56959 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FusP56959 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FusP56959 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FusP56959 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FusP56959 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FusP56959 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FusP56959 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FusP56959 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FusP56959 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FusP56959 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FusP56959 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FusP56959 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FusP56959 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FusP56959 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FusP56959 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FusP56959 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FusP56959 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FusP56959 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FusP56959 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FusP56959 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FusP56959 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FusP56959 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FusP56959 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FusP56959 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FusP56959 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FusP56959 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FusP56959 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FusP56959 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FusP56959 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FusP56959 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FusP56959 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FusP56959 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FusP56959 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FusP56959 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FusP56959 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FusP56959 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FusP56959 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FusP56959 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FusP56959 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FusP56959 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FusP56959 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FusP56959 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FusP56959 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FusP56959 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FusP56959 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FusP56959 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FusP56959 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FusP56959 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FusP56959 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FusP56959 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FusP56959 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FusP56959 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FusP56959 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FusP56959 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FusP56959 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FusP56959 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FusP56959 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FusP56959 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FusP56959 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FusP56959 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FusP56959 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FusP56959 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FusP56959 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FusP56959 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FusP56959 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FusP56959 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FusP56959 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FusP56959 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FusP56959 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FusP56959 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FusP56959 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FusP56959 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FusP56959 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FusP56959 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FusP56959 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FusP56959 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FusP56959 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FusP56959 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FusP56959 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FusP56959 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FusP56959 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FusP56959 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FusP56959 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms