Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn18P56857 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn18P56857 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms