Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdcd5P56812 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pdcd5P56812 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pdcd5P56812 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pdcd5P56812 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pdcd5P56812 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pdcd5P56812 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pdcd5P56812 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pdcd5P56812 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pdcd5P56812 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pdcd5P56812 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pdcd5P56812 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pdcd5P56812 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pdcd5P56812 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pdcd5P56812 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pdcd5P56812 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms