Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lim2P56563 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lim2P56563 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lim2P56563 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lim2P56563 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lim2P56563 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lim2P56563 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lim2P56563 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lim2P56563 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms