Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctbp2P56546 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctbp2P56546 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctbp2P56546 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.4 ms