Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irf5P56477 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irf5P56477 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irf5P56477 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Irf5P56477 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irf5P56477 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irf5P56477 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irf5P56477 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf5P56477 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf5P56477 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irf5P56477 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Irf5P56477 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms