Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gp1bbP56400 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gp1bbP56400 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gp1bbP56400 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.7 ms