Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rrp1P56183 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rrp1P56183 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rrp1P56183 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms