Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pex2P55098 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pex2P55098 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pex2P55098 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pex2P55098 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pex2P55098 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pex2P55098 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pex2P55098 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pex2P55098 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pex2P55098 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pex2P55098 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Pex2P55098 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms