Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acod1P54987 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acod1P54987 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acod1P54987 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acod1P54987 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acod1P54987 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acod1P54987 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acod1P54987 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acod1P54987 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acod1P54987 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Acod1P54987 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acod1P54987 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acod1P54987 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acod1P54987 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms