Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ephb3P54754 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ephb3P54754 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ephb3P54754 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms