Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PitpnbP53811 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PitpnbP53811 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms