Protein–RNA interactions for Protein: P53657

Pklr, Pyruvate kinase PKLR, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PklrP53657 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PklrP53657 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PklrP53657 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PklrP53657 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PklrP53657 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PklrP53657 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PklrP53657 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PklrP53657 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PklrP53657 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PklrP53657 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PklrP53657 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PklrP53657 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PklrP53657 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PklrP53657 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PklrP53657 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PklrP53657 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PklrP53657 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PklrP53657 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PklrP53657 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PklrP53657 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PklrP53657 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PklrP53657 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PklrP53657 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PklrP53657 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PklrP53657 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PklrP53657 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PklrP53657 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PklrP53657 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PklrP53657 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PklrP53657 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PklrP53657 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PklrP53657 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PklrP53657 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PklrP53657 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PklrP53657 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PklrP53657 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PklrP53657 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PklrP53657 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PklrP53657 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PklrP53657 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PklrP53657 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PklrP53657 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PklrP53657 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PklrP53657 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PklrP53657 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PklrP53657 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PklrP53657 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PklrP53657 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PklrP53657 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PklrP53657 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PklrP53657 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PklrP53657 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PklrP53657 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PklrP53657 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PklrP53657 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PklrP53657 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PklrP53657 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PklrP53657 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PklrP53657 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PklrP53657 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PklrP53657 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PklrP53657 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PklrP53657 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PklrP53657 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PklrP53657 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PklrP53657 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PklrP53657 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PklrP53657 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PklrP53657 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PklrP53657 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PklrP53657 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PklrP53657 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PklrP53657 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PklrP53657 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PklrP53657 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PklrP53657 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PklrP53657 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PklrP53657 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PklrP53657 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PklrP53657 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PklrP53657 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PklrP53657 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PklrP53657 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PklrP53657 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PklrP53657 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PklrP53657 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PklrP53657 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PklrP53657 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PklrP53657 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PklrP53657 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PklrP53657 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PklrP53657 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PklrP53657 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PklrP53657 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PklrP53657 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PklrP53657 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PklrP53657 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PklrP53657 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PklrP53657 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PklrP53657 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms