Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RabggtbP53612 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms