Protein–RNA interactions for Protein: P53568

Cebpg, CCAAT/enhancer-binding protein gamma, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpgP53568 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CebpgP53568 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CebpgP53568 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CebpgP53568 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CebpgP53568 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CebpgP53568 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CebpgP53568 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CebpgP53568 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpgP53568 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CebpgP53568 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CebpgP53568 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CebpgP53568 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CebpgP53568 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CebpgP53568 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CebpgP53568 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CebpgP53568 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CebpgP53568 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CebpgP53568 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CebpgP53568 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CebpgP53568 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CebpgP53568 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CebpgP53568 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CebpgP53568 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CebpgP53568 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CebpgP53568 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CebpgP53568 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CebpgP53568 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CebpgP53568 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CebpgP53568 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CebpgP53568 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CebpgP53568 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CebpgP53568 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CebpgP53568 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CebpgP53568 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CebpgP53568 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CebpgP53568 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CebpgP53568 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CebpgP53568 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CebpgP53568 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CebpgP53568 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CebpgP53568 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CebpgP53568 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CebpgP53568 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms