Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ube2e3P52483 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ube2e3P52483 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms