Protein–RNA interactions for Protein: P52019

Sqle, Squalene monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqleP52019 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SqleP52019 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SqleP52019 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SqleP52019 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SqleP52019 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SqleP52019 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SqleP52019 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SqleP52019 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SqleP52019 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SqleP52019 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SqleP52019 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SqleP52019 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SqleP52019 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SqleP52019 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SqleP52019 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SqleP52019 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SqleP52019 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SqleP52019 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SqleP52019 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SqleP52019 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SqleP52019 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SqleP52019 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SqleP52019 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SqleP52019 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SqleP52019 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SqleP52019 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SqleP52019 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SqleP52019 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SqleP52019 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SqleP52019 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SqleP52019 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SqleP52019 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SqleP52019 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SqleP52019 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SqleP52019 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SqleP52019 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SqleP52019 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SqleP52019 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SqleP52019 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SqleP52019 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SqleP52019 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SqleP52019 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SqleP52019 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SqleP52019 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SqleP52019 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SqleP52019 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SqleP52019 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SqleP52019 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SqleP52019 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SqleP52019 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SqleP52019 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SqleP52019 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SqleP52019 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SqleP52019 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SqleP52019 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SqleP52019 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SqleP52019 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SqleP52019 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SqleP52019 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SqleP52019 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SqleP52019 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SqleP52019 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SqleP52019 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SqleP52019 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SqleP52019 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SqleP52019 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SqleP52019 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SqleP52019 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SqleP52019 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SqleP52019 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SqleP52019 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SqleP52019 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SqleP52019 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SqleP52019 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SqleP52019 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SqleP52019 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SqleP52019 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SqleP52019 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SqleP52019 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SqleP52019 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SqleP52019 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SqleP52019 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SqleP52019 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SqleP52019 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SqleP52019 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SqleP52019 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SqleP52019 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SqleP52019 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SqleP52019 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SqleP52019 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SqleP52019 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SqleP52019 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SqleP52019 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SqleP52019 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SqleP52019 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SqleP52019 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SqleP52019 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SqleP52019 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SqleP52019 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SqleP52019 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms