Protein–RNA interactions for Protein: P51906

Slc1a1, Excitatory amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a1P51906 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc1a1P51906 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc1a1P51906 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc1a1P51906 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc1a1P51906 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc1a1P51906 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc1a1P51906 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc1a1P51906 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc1a1P51906 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc1a1P51906 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc1a1P51906 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc1a1P51906 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc1a1P51906 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms