Protein–RNA interactions for Protein: P51675

Ccr1, C-C chemokine receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr1P51675 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccr1P51675 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccr1P51675 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms