Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XpcP51612 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XpcP51612 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XpcP51612 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XpcP51612 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XpcP51612 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
XpcP51612 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
XpcP51612 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XpcP51612 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
XpcP51612 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
XpcP51612 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XpcP51612 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
XpcP51612 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XpcP51612 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XpcP51612 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XpcP51612 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XpcP51612 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
XpcP51612 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XpcP51612 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XpcP51612 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
XpcP51612 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XpcP51612 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XpcP51612 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XpcP51612 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
XpcP51612 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XpcP51612 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XpcP51612 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XpcP51612 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XpcP51612 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XpcP51612 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XpcP51612 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
XpcP51612 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XpcP51612 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XpcP51612 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XpcP51612 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XpcP51612 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XpcP51612 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XpcP51612 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XpcP51612 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
XpcP51612 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
XpcP51612 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XpcP51612 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
XpcP51612 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XpcP51612 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XpcP51612 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XpcP51612 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XpcP51612 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XpcP51612 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XpcP51612 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
XpcP51612 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
XpcP51612 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
XpcP51612 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
XpcP51612 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XpcP51612 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XpcP51612 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XpcP51612 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
XpcP51612 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XpcP51612 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XpcP51612 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
XpcP51612 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XpcP51612 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XpcP51612 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XpcP51612 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XpcP51612 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XpcP51612 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
XpcP51612 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XpcP51612 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XpcP51612 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XpcP51612 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XpcP51612 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XpcP51612 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XpcP51612 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XpcP51612 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XpcP51612 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XpcP51612 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XpcP51612 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XpcP51612 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XpcP51612 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XpcP51612 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XpcP51612 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XpcP51612 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XpcP51612 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XpcP51612 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XpcP51612 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XpcP51612 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XpcP51612 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XpcP51612 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XpcP51612 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XpcP51612 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XpcP51612 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
XpcP51612 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
XpcP51612 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
XpcP51612 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XpcP51612 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XpcP51612 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XpcP51612 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XpcP51612 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XpcP51612 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XpcP51612 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XpcP51612 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms