Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Defa-rs12P50716 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Defa-rs12P50716 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Defa-rs12P50716 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Defa-rs12P50716 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Defa-rs12P50716 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Defa-rs12P50716 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Defa-rs12P50716 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms