Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FanccP50652 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FanccP50652 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FanccP50652 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FanccP50652 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FanccP50652 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FanccP50652 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FanccP50652 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FanccP50652 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FanccP50652 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FanccP50652 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FanccP50652 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FanccP50652 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FanccP50652 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FanccP50652 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FanccP50652 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FanccP50652 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FanccP50652 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FanccP50652 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FanccP50652 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FanccP50652 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FanccP50652 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FanccP50652 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FanccP50652 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FanccP50652 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FanccP50652 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FanccP50652 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FanccP50652 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FanccP50652 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FanccP50652 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FanccP50652 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FanccP50652 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FanccP50652 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FanccP50652 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FanccP50652 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FanccP50652 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FanccP50652 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FanccP50652 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FanccP50652 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FanccP50652 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FanccP50652 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FanccP50652 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FanccP50652 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FanccP50652 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FanccP50652 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FanccP50652 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FanccP50652 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FanccP50652 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FanccP50652 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FanccP50652 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FanccP50652 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FanccP50652 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FanccP50652 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FanccP50652 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FanccP50652 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FanccP50652 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FanccP50652 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FanccP50652 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FanccP50652 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FanccP50652 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FanccP50652 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FanccP50652 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FanccP50652 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FanccP50652 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FanccP50652 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FanccP50652 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FanccP50652 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FanccP50652 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FanccP50652 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FanccP50652 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FanccP50652 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FanccP50652 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FanccP50652 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FanccP50652 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FanccP50652 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FanccP50652 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FanccP50652 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FanccP50652 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FanccP50652 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FanccP50652 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FanccP50652 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FanccP50652 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FanccP50652 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FanccP50652 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FanccP50652 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FanccP50652 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FanccP50652 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FanccP50652 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FanccP50652 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FanccP50652 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FanccP50652 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FanccP50652 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FanccP50652 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FanccP50652 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FanccP50652 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FanccP50652 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FanccP50652 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FanccP50652 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FanccP50652 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FanccP50652 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms