Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FmodP50608 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FmodP50608 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FmodP50608 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FmodP50608 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FmodP50608 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FmodP50608 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FmodP50608 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FmodP50608 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FmodP50608 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FmodP50608 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FmodP50608 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FmodP50608 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FmodP50608 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FmodP50608 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FmodP50608 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FmodP50608 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FmodP50608 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FmodP50608 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FmodP50608 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FmodP50608 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FmodP50608 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FmodP50608 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FmodP50608 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FmodP50608 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FmodP50608 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FmodP50608 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FmodP50608 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FmodP50608 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FmodP50608 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FmodP50608 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FmodP50608 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FmodP50608 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FmodP50608 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FmodP50608 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FmodP50608 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FmodP50608 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FmodP50608 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FmodP50608 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FmodP50608 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FmodP50608 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FmodP50608 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FmodP50608 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FmodP50608 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FmodP50608 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FmodP50608 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FmodP50608 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FmodP50608 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FmodP50608 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FmodP50608 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FmodP50608 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FmodP50608 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FmodP50608 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FmodP50608 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FmodP50608 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FmodP50608 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FmodP50608 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FmodP50608 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FmodP50608 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FmodP50608 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FmodP50608 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FmodP50608 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FmodP50608 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FmodP50608 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FmodP50608 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FmodP50608 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FmodP50608 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FmodP50608 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FmodP50608 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FmodP50608 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FmodP50608 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FmodP50608 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FmodP50608 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FmodP50608 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FmodP50608 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FmodP50608 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FmodP50608 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FmodP50608 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FmodP50608 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FmodP50608 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FmodP50608 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FmodP50608 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FmodP50608 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FmodP50608 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FmodP50608 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FmodP50608 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FmodP50608 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FmodP50608 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FmodP50608 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FmodP50608 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FmodP50608 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FmodP50608 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FmodP50608 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FmodP50608 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FmodP50608 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FmodP50608 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FmodP50608 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FmodP50608 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FmodP50608 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FmodP50608 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms