Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krt6aP50446 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt6aP50446 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms