Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LtbrP50284 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LtbrP50284 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LtbrP50284 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LtbrP50284 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LtbrP50284 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LtbrP50284 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LtbrP50284 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LtbrP50284 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LtbrP50284 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LtbrP50284 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LtbrP50284 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LtbrP50284 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LtbrP50284 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LtbrP50284 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LtbrP50284 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms