Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CtshP49935 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CtshP49935 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CtshP49935 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CtshP49935 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CtshP49935 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CtshP49935 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CtshP49935 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CtshP49935 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CtshP49935 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CtshP49935 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CtshP49935 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CtshP49935 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CtshP49935 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CtshP49935 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CtshP49935 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CtshP49935 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CtshP49935 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CtshP49935 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CtshP49935 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CtshP49935 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CtshP49935 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CtshP49935 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CtshP49935 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CtshP49935 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CtshP49935 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CtshP49935 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CtshP49935 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CtshP49935 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CtshP49935 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CtshP49935 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CtshP49935 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CtshP49935 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CtshP49935 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CtshP49935 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CtshP49935 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CtshP49935 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CtshP49935 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CtshP49935 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtshP49935 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtshP49935 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtshP49935 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtshP49935 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtshP49935 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtshP49935 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtshP49935 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtshP49935 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtshP49935 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtshP49935 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtshP49935 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtshP49935 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtshP49935 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtshP49935 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtshP49935 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtshP49935 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtshP49935 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtshP49935 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CtshP49935 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtshP49935 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtshP49935 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtshP49935 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CtshP49935 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CtshP49935 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CtshP49935 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CtshP49935 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CtshP49935 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CtshP49935 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CtshP49935 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CtshP49935 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CtshP49935 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CtshP49935 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CtshP49935 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CtshP49935 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CtshP49935 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CtshP49935 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CtshP49935 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CtshP49935 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CtshP49935 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CtshP49935 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CtshP49935 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CtshP49935 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtshP49935 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtshP49935 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtshP49935 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtshP49935 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CtshP49935 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CtshP49935 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CtshP49935 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CtshP49935 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CtshP49935 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CtshP49935 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CtshP49935 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CtshP49935 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtshP49935 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtshP49935 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtshP49935 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtshP49935 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CtshP49935 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtshP49935 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CtshP49935 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms