Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VegfbP49766 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VegfbP49766 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VegfbP49766 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VegfbP49766 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VegfbP49766 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VegfbP49766 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VegfbP49766 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VegfbP49766 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VegfbP49766 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VegfbP49766 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VegfbP49766 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VegfbP49766 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VegfbP49766 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VegfbP49766 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VegfbP49766 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VegfbP49766 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VegfbP49766 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VegfbP49766 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VegfbP49766 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VegfbP49766 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VegfbP49766 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VegfbP49766 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VegfbP49766 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VegfbP49766 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VegfbP49766 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VegfbP49766 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VegfbP49766 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VegfbP49766 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VegfbP49766 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms