Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnni3P48787 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni3P48787 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnni3P48787 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms