Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Abcd1P48410 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcd1P48410 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcd1P48410 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms