Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Edn3P48299 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edn3P48299 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edn3P48299 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edn3P48299 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Edn3P48299 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Edn3P48299 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edn3P48299 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edn3P48299 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Edn3P48299 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edn3P48299 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edn3P48299 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edn3P48299 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Edn3P48299 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Edn3P48299 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Edn3P48299 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edn3P48299 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edn3P48299 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Edn3P48299 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms