Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl11P48298 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccl11P48298 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms