Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Resp18P47939 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Resp18P47939 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Resp18P47939 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Resp18P47939 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Resp18P47939 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Resp18P47939 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Resp18P47939 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Resp18P47939 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Resp18P47939 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Resp18P47939 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Resp18P47939 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Resp18P47939 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Resp18P47939 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Resp18P47939 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Resp18P47939 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Resp18P47939 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Resp18P47939 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Resp18P47939 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms